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磷脂分子POPE的浮動電荷分子力場

宮利東  趙力儐  田博  楊忠志  
【摘要】:應用量子化學(QM)計算和原子-鍵電負性均衡浮動電荷分子力場(ABEEMσπ/MM)方法,建立1-棕櫚酰-2-油酰基-磷脂酰乙醇胺(POPE)分子的浮動電荷力場.將POPE分子的極性頭部分為乙基三甲基銨(ETMA)、乙酸甲酯(MAS)和磷酸二甲酯(DMP)等小分子片段,根據QM計算結果,調節優選ABEEMσπ/MM參數.利用建立的ABEEMσπ/MM勢能函數對模型分子進行計算,與QM結果相比,鍵長、鍵角、二面角的最大絕對平均偏差(AAD)分別為0.0219nm、2.39°和2.61°,電荷分布的線性相關系數均在0.97以上.進一步對磷脂分子POPE的結構和電荷分布進行計算,與QM結果對比,得到的鍵長、鍵角、二面角參數的AAD分別為0.000 1nm、0.31°和0.34°,RMSD分別為0.83%、0.46%、0.45%,電荷分布的線性相關系數為0.981 3.

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